این دارو در درمان باکتری های حاد گرم منفی مخصوصا گونه سودومونا آئروژینوزا کاربرد دارد. کولیستی متات بصورت استنشاقی در درمان عفونت های تنفسی مخصوصا در بیماران سیستیک فیبروزیس مصرف می شود. کولیستین از راه خوراکی بصورت سولفات در درمان عفونت های دستگاه گوارش به همراه سایر داروها برای ضدعفونی انتخابی دستگاه گوارش در بیمارانی که در معرض ریسک خطر بالای عفونت داخلی هستند بکار می رود.